Puerto Vallarta es una zona que fue bendecida por la naturaleza en cuanto a variedad de flora y de fauna, tanto terrestre como marina, debido a su prodigioso punto geográfico, justo en el límite de la Sierra Madre Occidental y el Océano Pacífico y su maravilloso clima tropical. Los últimos años poco a poco han ido surgiendo empresas dedicadas al ecotuturismo, las cuales con han tratado de generar el mínimo impacto ambiental para que los visitantes logren captar la belleza geográfica de la Bahía de Banderas, al tiempo que se puede observar una enorme cantidad de animales y plantas endémicas; así como fauna migrante. Varis de ellas se han dedicado a la observación de ballenas; así como a la liberación de tortugas marinas, lo que genera que dichas especies, más que ser cazadas, estas empresas ven el beneficio que a largo plazo pueden dejar para los habitantes del sitio.

Sin embargo, sigue habiendo un animal que sigue causando temor entre muchos de los habitantes de la ciudad, por la peligrosidad que podría representar para el ser humano, este animal es el cocodrilo, el cual ha sido calumniado, ya que de este se habla que en la bahía habitan miles de individuos, cuando realmente la población de estos saurio no sobrepasa los 300 ejemplares. Así como la observación de ballenas y la liberación de tortugas, son actividades que pueden brindar dividendos económicos, la observación de cocodrilos podría dejar muy buena derrama económica para el destino. Tal situación no es nueva, en Costa Rica se ha creado todo una industria en torno a la observación de estos reptiles, la cual deja miles de divisas a las regiones en las que se promueve la observación de estos saurios. De hecho, en Jalisco, específicamente en La Manzanilla, municipio de La Huerta, los ejidatarios dejaron de cazarlo y crearon espacios para que los turistas puedan observar el saurio sin que esto represente peligro para el turista que desea conocer estos animales. De tal suerte que un cocodrilo vivo, puede valer mucho más que diez cocodrilos cazados.